南京所现有在职职工803人，其中工程院院士1人，高级职称244人，博士252人，硕士427人，国家“百千万人才”1人，享受国务院政府特殊津贴11人；江苏省突出贡献中青年专家2人、江苏省“333工程”高层次人才48人、江苏省“双创”博士及卓越博士后等省级人才64人；环境?；ぷㄒ导际趿炀瞬偶扒嗄臧渭馊瞬?4人。已形成一支以知名专家为引领、各领域科研骨干为依托、青年科技人员为主体的创新型人才队伍。

“十四五”以来，获国家科技进步奖二等奖2项，获省部级科技奖50项。共发表论文900余篇，其中SCI论文551篇，中科院一区及以上142篇。授权国际发明专利120项，国家发明专利406项。报送各类政策建议233份，获中央领导批示4份、省部级领导批示41份。

南京所主办的《生态与农村环境学报》(月刊)系生态环境部主管的中文核心期刊，学术影响一直在我国环境?；ち煊蚱诳忻星懊暇┧肓瞎肪呈?、世界自然?；ち说?0多个国际组织，以及美国、德国、荷兰、挪威等30多个国家开展了广泛的科研项目合作和人员交流。南京所和南京大学联合创办英文期刊Eco-Environment & Health，期刊以“大健康”理念为核心，关注生态、环境与健康的交互作用；重点聚焦生态与生物多样性保护，新污染物的环境归趋与生物过程，人体暴露与健康效应，环境风险的评价、管理与调控四个方向。

建所以来，南京所始终秉承“团结、奉献、求实、创新”的所训，积极参与国家和地方重大科研项目，已成为我国环境科技界的一支重要力量，为国家环境管理决策和深入打好污染防治攻坚战提供了有力的科技支撑，为各地的生态建设和污染防治提供了全方位的技术支持和服务。